新版~2019年4月26日更新敬請點入：【馬祖小三通】南竿福澳港（新）旅運大樓．黃岐/馬尾/琅岐．小三通出境通關
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2017年4月南竿福澳港旅運大樓落成啟用， 航港局隨即於同年9月開辦提供本國籍南竿旅客搭乘馬祖小三通「北竿－黃岐」航線，可直接在南竿辦理通關，船到北竿後，人跟行李不用下船，原船直接開到黃岐，對住在南竿的JC來說是相當便利的措施，不用在提著大包小包下船繞北竿通關口一圈在大包小包原船回座，這種87的行為總算消失了。
▼ 小三通航線、台馬輪和台馬之星購票侯船相同都是在福澳港旅運大樓，因為所有開航的時間都錯開了，所以也不必太去擔心搞錯船隻上船的問題，至於舊大樓也開始整修，因此小三通、新華售票作業先暫時搬至新大樓，待完成整修後新舊大樓的售票、通關如何分配，也是靜待分曉的事，總之目前就是全擠在這裡。
▼ 往前走指示相當的清楚
▼ 出境大廰門口
▼ 售票處，JC出發的那天浪象不太佳所以南竿搭船的不到10人，不過真正搭乘時並沒有想像中那麼的搖晃
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▼ 上午由南竿聯乘出發到黃岐最晚的售票時間是9：20
▼ 通關、開航...等相關說明
▼ 購票和通關時相關文件說明請點入：馬祖小三通必備證件 3+1（3證件 + 1船票）
馬祖本地居民事先訂位可享南北竿聯乘優惠票50+50元（沒訂票的是110+110元，非本地居民是160+160元）
▼ 通關，嘿嘿拍謝，今天真的嘸人只有JC好友四人，準備包船了
▼ 入出境免稅商店，小小一區，販售煙酒化妝品為主(注意開航時間別買到忘了時間呀，不過服務員都會提醒啦^^)
▼ 免稅店出來後看到船隻就可以上船啦，怕搭錯的請自行再三尋問確定（很難有誤吧@@）
▼ 船內空間，今天JC搭的是吉順9號，2016年新船可容納145人
▼ 9：40由南竿準時開航，大約 9：50就到北竿碼頭了，北竿白沙碼頭通關的旅客已經在碼頭等候上船，所以也很準時的10：00準時啟程前往黃岐碼頭小三通之旅
▼ 25分鐘的航程很快就到黃岐港碼頭了唷
下船後的交通請點入連結說明：【馬祖小三通】JC教你如何從 “黃岐港碼頭” 到 “連江/福州”
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